A与T或A与U之间是两个氢键，G与C之间是三个氢键 。
氢原子与电负性大、半径小的原子X以共价键结合 ， 若与电负性大的原子Y接近，在X与Y之间以氢为媒介，生成一种特殊的分子间或分子内相互作用，称为氢键 。
【那两个碱基对之间是两个氢键】2013年11月22日，中科院国家纳米科学中心宣布，该中心科研人员在国际上首次拍到氢键的照片，实现了氢键的实空间成像，为氢键的本质这一化学界争论了80多年的问题提供了直观证据 。这不仅将人类对微观世界的认识向前推进了一大步 ， 也为在分子、原子尺度上的研究提供了更精确的方法 。
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