购买种子时选择能提供植物检疫证明的正规种子经销单位，并索要购买凭证 。
播种前进行种子处理，可用福尔马林100倍液浸种30分钟后，水洗3至5遍晾干，或1%盐酸浸种15分钟后，水洗3至5遍晾干 。
生长期间喷施1至2次杀细菌剂进行保护性防治，可选用铜制剂或硫酸链霉素等抗生素，施药时应注意不同类型药剂的轮换使用，以防病菌产生抗药性 。由于果斑病菌早期能通过雌花柱头侵染瓜类作物，可以使用芽孢杆菌、非致病性嗜酸菌、植物附生酵母和荧光假单孢等生物药剂进行花期保护 。
【瓜类细菌性果斑病预防措施】灌溉方式宜选用滴灌、地面灌溉，不宜使用喷灌，以减少病菌传播 。田间管理注意湿度调节，降低湿度有利于减缓病害发生 。条件许可时应进行轮作倒茬 。

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